神户大学主校区位于日本国兵库县神户市滩区六甲台町1-1，此外，医学部与医学研究科位于神户市楠町（神户市西部），海事学部与海事研究科位于神户市深江町（神户市东部）。 为日本最早设立经营学大学院的大学。同时，发行的《国民经济杂志》创刊于1906年，是日本最早的经济学、商业学专业学术杂志。

神户大学的历史以1902年神户高等商业学校建校为起点。1869年神户病院开院，并于1876年开设医学所。1874年兵库县师范传习所开学。1902年神户高等商业学校建校，1929年改称神户商业大学。1944年改称神户经济大学。1945年之后，以上诸源相继合流，于1949正式称为神户大学。
神户大学设有文学部（人文学科）、国际文化学部（国际文化学科）、发达科学部（人类形成学科、人类行动学科、人类表现学科、人类环境学科）、法学部（法律学科）、经济学部（经济学科）、经营学部（经营学科）、理学部（数学科、物理学科、化学科、生物学科、地球行星科学科）、医学部（医学科、保健学科）、工学部（建筑学科、市民工学科、电气电子工学科、机械工学科、应用化学科、情报智能工学科）、农学部（食料环境系统学科、资源生命科学科、生命机能科学科）、海洋科学部（海洋技术经营管理学科、海洋物流科学科、海洋工学技术学科），大学院设有人文学研究科、国际文化学研究科、人类发达环境学研究科、法学研究科、经济学研究科、经营学研究科、理学研究科、医学研究科、保健学研究科、工学研究科、农学研究科、海事科学研究科、国际协力研究科。

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